如果网站被加入JS后门，建议采取以下措施：
1、及时备份网站数据，以便在处理过程中出现意外时可以恢复数据。
2、确认是否存在漏洞，及时修补漏洞，防止攻击者再次利用漏洞进行攻击。
3、删掉加入后门的JS文件，并更新所有网站文件以确保网站没有其他安全问题。
4、通过检测和清除恶意代码，确保网站没有被感染或攻击者没有在其他地方留下后门。
5、审查服务器和网站的安全设置，确保安全设置符合最佳实践。
6、分析存储在网站数据库中的数据，确认是否有数据泄露或篡改的情况，并及时采取措施应对。
7、安装防火墙、杀毒软件等安全工具，并将其及时更新到最新版本。
8、针对可能的用户受害者，及时通知并提供必要的帮助和解决方案。
以上措施是比较常见的应对网站被加入JS后门的方法，但是对于严重的后门或攻击，建议及时寻求专业人员的支持。另外，为了避免JS后门的出现，建议平时注意网站安全，定期检测和更新网站文件，及时修补漏洞等。
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